Aislamiento y caracterización de 17 microsatélites polimórficos en un erizo de mar (Echinometra lucunter: Echinometridae)
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Benavides Serrato, M., Contreras-Rueda, Y. F., Barrios-Gardelis, L. M., Fox, G., Hughes, T. D., Campos-Campos, N. H., & Preziosi, R. (2020). Aislamiento y caracterización de 17 microsatélites polimórficos en un erizo de mar (Echinometra lucunter: Echinometridae). Rev. Acad. Colomb. Cienc. Ex. Fis. Nat., 44(172), 759-767. https://doi.org/10.18257/raccefyn.1113

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Resumen

Como primer paso para establecer la estructura genética del erizo de mar Echinometra lucunter lucunter a lo largo del Caribe, se aislaron 26 microsatélites usando secuenciación de extremo pareado (Next Generation Sequencing, NGS) Illumina. Se optimizaron exitosamente 17 marcadores y se probó su variación alélica en 23 individuos recolectados a lo largo del mar Caribe y en Cabo Verde, Atlántico oriental tropical. El número de alelos por locus (Na) fluctuó entre cuatro y 24, la heterocigosidad observada (Ho) entre 0,682 y 1 y la heterocigosidad esperada (He), entre 0,609 y 0,9304. No hubo desequilibrio de ligamento entre los pares de locus detectados. Los microsatelites aislados e identificados se usarán por primera vez para detectar la influencia de las barreras marinas en el flujo génico del erizo E. lucunter lucunter a lo largo del mar Caribe. Estos nuevos marcadores serán esenciales para la conservación y los estudios de conectividad a través del mar Caribe y el océano Atlántico, área donde se distribuye la especie.

https://doi.org/10.18257/raccefyn.1113
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Referencias

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