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Abstract
EBA-181, antigen of Plasmodium falciparum, binds to red blood cells, suggesting a role in the merozoite invasion. It was applied a previously developed methodology based on probability and entropy, to the characterization of high-binding EBA-181 peptides to red blood cells. Values of probability, probability summation and entropy were calculated for the 79 not overlapped sequences of the protein; the calculations were also made for analogous theoretical peptides, built from the binding peptides. The specific sequences experimentally proved as high binding ones had values into the ranges associated to the binding macrostate, differentiating the sequences that bind and not bind with a right guess of 100% in the studied cases.
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References
Adams JH, Blair PL, Kaneko O, Peterson DS. 2001. An expanding ebl family of Plasmodium falciparum. Trend Parasitol. 17(6):297-9.
Aikawa M, Miller LH, Johnson J, Rabbege. 1978. Erythrocyte entry by malarial parasites. A Moving junction between erythrocyte and parasite. J Cell Biol. 77:72-82.
Chitnis CE, Blackman MJ. 2000. Host cell invasion by malaria parasites. Parasitol. 16:411-415.
Gilberger TW, Thompson JK, Reed MB, Good RT, Cowman AF. 2003. The cytoplasmic domain of the Plasmodium falciparum ligand EBA-175 is essential for invasion but not protein trafficking. J Cell Biol. 162(2):317-27.
Feynman RP, Leighton RB, Sands M. 1998a. Física, Probabilidad, Vol. 1. Addison-Wesley Iberoamericana, Wilmington, S. A. México, p. 6-1, 6-16.
Feynman RP, Leighton RB, Sands M. 1998b. Física. Leyes de la Termodinámica, Vol. 1. Addison-Wesley Iberoamericana, Wilmington, S. A. México p. 44-1, 44-19
Frodden E, Royo J. 2004. Entropía e Información, Seminario Final del curso de Termodinámica, Depto. de Física, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile. Disponible en http://fi sica.ciencias.uchile.cl/~gonzalo/cursos/termo_II-4/ seminarios/seminarios1.htm.
Mayer DC, Mu JB, Kaneko O, Duan J, Su XZ, Miller LH. 2004. Polymorphism in the Plasmodium falciparum erythrocyte-binding ligand JESEBL/EBA-181 alters its receptor specificity. Proc Natl Acad Sci U S A. 11(8):2518-23. Ministerio de Protección Social. 2006. Guía de atención de la malaria. Bogotá.
Rodríguez J. 2008a. Caracterización física y matemática de péptidos de alta unión de MSP-1 mediante la aplicación de la teoría de la probabilidad y la entropía. Arch alerg inmunol clin. 39(2):74-82.
Rodríguez J. 2008b. Teoría de unión al HLA clase II: Teoría de probabilidad, combinatoria y Entropía aplicadas a secuencias peptídicas. Inmunología; 27:151-166.
Rodríguez J, Correa C, Prieto S, Puerta G, Vitery S, Bernal P, Soracipa Y, Botero D. 2009a. Aplicación de la probabilidad y la entropía a la proteína EBA-140. Caracterización matemática de péptidos de alta unión. Inmunología. 28(2):65-73.
Rodríguez J, Correa C, Prieto S, Cardona D, Vitery S, Puerta G, Soracipa Y, Bernal P. 2009b. Caracterización física y matemática de péptidos de alta unión de MSA-2 aplicación de la teoría de la probabilidad y la entropía. Rev Acad Colomb Cienc. 33(129):549-557.
Rodríguez J, Bernal P, Prieto S, Correa C. 2010. Teoría de péptidos de alta unión de malaria al glóbulo rojo. Predicciones teóricas de nuevos péptidos de unión y mutaciones teóricas predictivas de aminoácidos críticos. Inmunología. 29(1):7-19.
Rodríguez J. 2010a. Método para la predicción de la dinámica temporal de la malaria en los municipios de Colombia. Rev Panam Salud Pública. 27(3):211-8.
Rodríguez J. 2010b. Entropía Proporcional De Los Sistemas Dinámicos Cardiacos: Predicciones físicas y matemáticas de la dinámica cardiaca de aplicación clínica. Rev Colomb Cardiol. 17:115-129.
Rodríguez J, Prieto S, Correa C, Bernal P, Puerta G, Vitery S, Soracipa Y, Muñoz D. 2010c. Theoretical generalization of normal and sick coronary arteries with fractal dimensions and the arterial intrinsic mathematical harmony. BMC Medical Physics. 10:1 http://www.bio-medcentral.com/1756-6649/10/1
Rodríguez J. 2011. Generalización fractal de células preneoplásicas y Cancerígenas del epitelio escamoso cervical. Una nueva Metodología de aplicación clínica. Rev. Fac Med. 18(2): 173-181.
Rodríguez J, Prieto S, Bernal P, Soracipa Y, Salazar G, Izasa D, Cruz LE, Correa C. 2011a. Nueva metodología diagnóstica de la dinámica geométrica cardiaca. Dinámica cardiaca caótica del Holter. Rev Acad Colomb Cienc 35(134):5-12.
Shuman E. 2010. Global Climate Change and Infectious Diseases. N Engl J Med. 362:12.
Vera-Bravo R, Valbuena J, Ocampo M, Garcia J, Rodríguez L, Puentes A, López R, et al. 2005. Amino terminal peptides from the Plasmodium falciparum EBA-181/JESEBL protein bind specifically to erythrocytes and inhibit in vitro merozoite invasion. Biochimie 87:425–436.
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